La Ciuden promoverá además, según esta misma publicación ministerial "los proyectos que impulsen la transición justa". Y es que la finalidad de estas subvenciones es "contribuir al fortalecimiento del tejido empresarial y apoyar el desarrollo de iniciativas empresariales y sociales; Potenciar los estudios ambientales relacionados con la energía y desarrollar y aplicar técnicas de recuperación medioambiental; Contribuir mediante actividades de dirección, diseño, coordinación y ejecución, a la restauración de las zonas degradas por la actividad minera; Promover, ejecutar y gestionar proyectos de implantación de tecnologías renovables y eficiencia energética y de soluciones tecnológicas para un sistema energético descarbonizado; Promover la investigación y el desarrollo tecnológico en materia energética en todos sus aspectos: Descarbonización, digitalización, descentralización, etc.f; Potenciar vías para la formación de investigadores y técnicos en aquellas materias que se requieran en relación con las áreas de desarrollo; Contribuir a la recuperación del patrimonio industrial minero de los territorios implicados en el proceso de transición energética, teniendo en cuenta su valor patrimonial o criterios de oportunidad de utilización del mismo, con otras aplicaciones de carácter cultural, comercial, museístico, industrial, etc ; Gestión de los proyectos e instalaciones propias de la Fundación.
Estas líneas de subvención se asimilan en parte al programa de Desarrollo del Territorio vinculado a la CIUDEN desde sus inicios, y cuya supresión llegó con la entrada del PP en el Gobierno bajo el argumento de competencias impropias que podrían incluso considerarse una 'diputación BIS' e incluso de Consejerías de la Junta (caso de la restauración de escombreras mineras). Aquel programa alumbró iniciativas como Bierzo Enoturismo, agrupaciones de iniciativas empresariales, talleres de empleo... y fue cercenado por Melchor Ruiz tras su incorporación como director de la Fundación Ciudad de la Energía en mayo de 2012.